新发现传染病，指新确定和先前未知的，可引起局部或世界范围内公共卫生问题的传染病，例如艾滋病、疯牛病、禽流感、SARS，并且包括死灰复燃的、重新对人类健康构成威胁的传染病，例如血吸虫病、结核病等。
　　
　　 据介绍，在我国发生流行的新传染病有SARS、艾滋病、肠出血性大肠杆菌O157：H7、O139霍乱、军团病、空肠弯曲菌肠炎、莱姆病、丙型肝炎、庚型肝炎、戊型肝炎、汉坦病毒、B组轮状病毒腹泻、禽流感、巴尔通体感染14种。